Guide for writing Python code using Matlantis, PFN's cloud-based atomistic simulation platform powered by neural network potentials (PFP). Use this skill whenever the user asks about Matlantis, PFP (Preferred Potential), matlantis-features, pfp-api-client, MTCSP, or any atomistic/molecular simulation on the Matlantis platform. Also trigger when code involves imports like pfpapiclient, matlantisfeatures, or mtcspapiclient.
EnglishASE (Atomic Simulation Environment) の基礎操作を扱うスキルです。 Atoms オブジェクトの生成・編集、ase.build.molecule, ase.build.bulk, repeat, supercell, PBC (periodic boundary conditions), cell, positions, getchemicalformula, getdistance, translate, center, 分子と結晶の違い、構造ファイルの読み書き(ase.io.read/write)…
Japanese表面への分子吸着を扱うスキルです。 吸着エネルギー, adsorption energy, 吸着構造, adsorption structure, 吸着サイト探索, adsorption site search, addadsorbate, ontop, bridge, fcc, hcp, 吸着サイト, slab+molecule, FixAtoms, 下層固定, D3分散補正, pbeplusd3, Optuna, ブラックボックス最適化, 被覆率, coverage…
Japanese分子動力学(MD)シミュレーションを扱うスキルです。 Langevin, VelocityVerlet, NVTBerendsen, NPTBerendsen, NVE, NVT, NPT, MaxwellBoltzmannDistribution, thermalizemomenta, exacttemperature, MDLogger, timestep, friction, temperatureK, MDFeature, MDFeatureResult, ASEMDSystem, LangevinIntegrator, NPTIntegrator, チェックポイント, checkpoint, PostMDDiffusionFeature, PostMDSpecificHeatFeature, PostEMDViscosityFeature, PostNEMDViscosityFeature, PostNEMDThermalConductivityFeature, PLUMED, メタダイナミクス, metadynamics, FES, collective variable, 熱分解, pyrolysis, getmollist, フラグメント解析, fragment analysis, DepositionScheduler, ApplyUniformEfield, ElasticVirtualWall, Matlantis-LAMMPS, LAMMPS, OpenMM, pairstyle pfpapi, 分子動力学, MD, 拡散係数, 粘度, 熱伝導率…
Latin物性計算とMD後処理を扱うスキルです。 ElasticTensorFeature, PostElasticPropertiesFeature, 弾性定数, elastic, Young率, バルク弾性率, ForceConstantFeature, PostPhononBandFeature, PostPhononDOSFeature, PostPhononThermochemistryFeature, フォノン, phonon, 力定数, QHA, 準調和近似, VibrationFeature, 振動解析, PostMDDiffusionFeature, 拡散係数, MSD, 平均二乗変位, PostEMDViscosityFeature, PostNEMDViscosityFeature, 粘度, Green-Kubo, PostNEMDThermalConductivityFeature, 熱伝導率, PostMDSpecificHeatFeature, 比熱, PostMDThermalExpansionFeature, 熱膨張, GasStandardFormationEnthalpyFeature, PostVibrationGasThermoFeature, ガス熱化学, RDF, 動径分布関数, 振動状態密度…
Japanese反応経路探索・遷移状態探索を扱うスキルです。 NEB, Nudged Elastic Band, NEBFeature, NEBTools, climbing image, CI-NEB, ReactionStringFeature, fmaxrp, fmaxts, fmaxrd, fmaxeq, RestScanFeature, ScanDistance, ScanDihedral, modifytrajectorybymic, 原子マッピング, atom mapping, 反応経路, reaction path, 遷移状態, transition state, 活性化エネルギー, activation energy, エネルギー障壁, energy barrier, IDPP, allowsharedcalculator, 吸着サイト探索, adsorption site search…
Japanese原子構造とトラジェクトリの可視化を扱うスキルです。 showgui, pfccextras, nglview, showase, showasetraj, viewngl, ase.visualize.view, POV-Ray, 可視化, visualization, 構造確認, 目視チェック, trajectory 表示…
Japanesepfccextras (Matlantis/ASE workflow utilities) を使うコード生成時に使用します。 可視化 (showgui, viewngl, SurfaceEditor)、構造加工 (smilestoatoms, LiquidGenerator, makealloy, makesurface, 各種 interface)、MD スケジューラー (DepositionScheduler, ApplyUniformEfield など)、物性解析 (MonteCarlo, GCMC, calculatebulkmodulus, 粘度・熱伝導率, trajectory 変換)、吸着・構造探索 (adsorptionstructuresearch)、ジョブ実行制御 (runjobs, ResourceAwareJobScheduler, parameter sweep)…
Japanese
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Cursor
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Gemini CLISupported by the Atlas install prompt. Skill-specific requirements vary.
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What’s included
Matlantis
Guide for writing Python code using Matlantis, PFN's cloud-based atomistic simulation platform powered by neural network potentials (PFP). Use this skill whenever the user asks about Matlantis, PFP (Preferred Potential), matlantis-features, pfp-api-client, MTCSP, or any atomistic/molecular simulation on the Matlantis platform. Also trigger when code involves imports like pfpapiclient, matlantisfeatures, or mtcspapiclient.
Ase Basics
ASE (Atomic Simulation Environment) の基礎操作を扱うスキルです。 Atoms オブジェクトの生成・編集、ase.build.molecule, ase.build.bulk, repeat, supercell, PBC (periodic boundary conditions), cell, positions, getchemicalformula, getdistance, translate, center, 分子と結晶の違い、構造ファイルの読み書き(ase.io.read/write) に関するコード生成時に使用してください。
Mt Adsorption
表面への分子吸着を扱うスキルです。 吸着エネルギー, adsorption energy, 吸着構造, adsorption structure, 吸着サイト探索, adsorption site search, addadsorbate, ontop, bridge, fcc, hcp, 吸着サイト, slab+molecule, FixAtoms, 下層固定, D3分散補正, pbeplusd3, Optuna, ブラックボックス最適化, 被覆率, coverage に関するコード生成時に使用してください。
Mt Dynamics
分子動力学(MD)シミュレーションを扱うスキルです。 Langevin, VelocityVerlet, NVTBerendsen, NPTBerendsen, NVE, NVT, NPT, MaxwellBoltzmannDistribution, thermalizemomenta, exacttemperature, MDLogger, timestep, friction, temperatureK, MDFeature, MDFeatureResult, ASEMDSystem, LangevinIntegrator, NPTIntegrator, チェックポイント, checkpoint, PostMDDiffusionFeature, PostMDSpecificHeatFeature, PostEMDViscosityFeature, PostNEMDViscosityFeature, PostNEMDThermalConductivityFeature, PLUMED, メタダイナミクス, metadynamics, FES, collective variable, 熱分解, pyrolysis, getmollist, フラグメント解析, fragment analysis, DepositionScheduler, ApplyUniformEfield, ElasticVirtualWall, Matlantis-LAMMPS, LAMMPS, OpenMM, pairstyle pfpapi, 分子動力学, MD, 拡散係数, 粘度, 熱伝導率 に関するコード生成時に使用してください。
Mt Property Analysis
物性計算とMD後処理を扱うスキルです。 ElasticTensorFeature, PostElasticPropertiesFeature, 弾性定数, elastic, Young率, バルク弾性率, ForceConstantFeature, PostPhononBandFeature, PostPhononDOSFeature, PostPhononThermochemistryFeature, フォノン, phonon, 力定数, QHA, 準調和近似, VibrationFeature, 振動解析, PostMDDiffusionFeature, 拡散係数, MSD, 平均二乗変位, PostEMDViscosityFeature, PostNEMDViscosityFeature, 粘度, Green-Kubo, PostNEMDThermalConductivityFeature, 熱伝導率, PostMDSpecificHeatFeature, 比熱, PostMDThermalExpansionFeature, 熱膨張, GasStandardFormationEnthalpyFeature, PostVibrationGasThermoFeature, ガス熱化学, RDF, 動径分布関数, 振動状態密度 に関するコード生成時に使用してください。
Mt Reaction
反応経路探索・遷移状態探索を扱うスキルです。 NEB, Nudged Elastic Band, NEBFeature, NEBTools, climbing image, CI-NEB, ReactionStringFeature, fmaxrp, fmaxts, fmaxrd, fmaxeq, RestScanFeature, ScanDistance, ScanDihedral, modifytrajectorybymic, 原子マッピング, atom mapping, 反応経路, reaction path, 遷移状態, transition state, 活性化エネルギー, activation energy, エネルギー障壁, energy barrier, IDPP, allowsharedcalculator, 吸着サイト探索, adsorption site search に関するコード生成時に使用してください。
Mt Visualization
原子構造とトラジェクトリの可視化を扱うスキルです。 showgui, pfccextras, nglview, showase, showasetraj, viewngl, ase.visualize.view, POV-Ray, 可視化, visualization, 構造確認, 目視チェック, trajectory 表示 に関するコード生成時に使用してください。
Pfcc Extras
pfccextras (Matlantis/ASE workflow utilities) を使うコード生成時に使用します。 可視化 (showgui, viewngl, SurfaceEditor)、構造加工 (smilestoatoms, LiquidGenerator, makealloy, makesurface, 各種 interface)、MD スケジューラー (DepositionScheduler, ApplyUniformEfield など)、物性解析 (MonteCarlo, GCMC, calculatebulkmodulus, 粘度・熱伝導率, trajectory 変換)、吸着・構造探索 (adsorptionstructuresearch)、ジョブ実行制御 (runjobs, ResourceAwareJobScheduler, parameter sweep) を扱います。
Quick start
- Choose your skills. Select individual skills above, or choose the entire pack.
- Copy the install prompt. Use Copy install prompt above the list.
- Send it to your agent. Paste into your coding agent’s chat. Your agent reviews the source and guides the setup.
Try it with your agent
After installation, start with a request like:
Use the Matlantis skill to help with my task.
Ask me for the context you need before getting started.Requirements & license
- A coding agent that can access your project files and install skills.
- Your agent checks each skill’s instructions, dependencies, and permissions during setup.
- Reported license for the skills shown: Apache-2.0. The author’s terms apply.